Фамилия Праунин — довольно редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основу стоит искать не в славянских корнях, а в прибалтийско-финском или немецком влиянии, что сразу выделяет её из ряда типичных русских фамилий.

Словообразовательная модель здесь ясна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Так образовывали фамилии от основ, оканчивающихся на -а или -я: Прауна → Праунин. Следовательно, предка носителя фамилии звали или прозывали Прауной. Вопрос в том, что означало это прозвище.

Самая вероятная версия ведёт к личному имени Праунас (Praūnas). Это литовское или жемайтийское имя, родственное латышскому Prauns. В основе лежит балтийский корень со значением «быстрый», «проворный», «резвый». В Литве и Латвии такие имена давали детям, желая им ловкости и живости. Если предок Прауниных был выходцем из западнорусских земель (Смоленщина, Псковщина, Беларусь) или из числа литовских переселенцев, фамилия легко могла возникнуть именно так.

Есть и вторая, менее вероятная версия — от немецкого прозвища Braun («коричневый», «смуглый»), которое через диалектное произношение или при переписи могло трансформироваться в «Праун». Немецкое влияние характерно для Прибалтики и Санкт-Петербургской губернии, где фамилии с суффиксом -ин давали иноязычным жителям. Однако в этом случае мы бы ожидали больше вариантов вроде Браунин, и форма Праунин выглядит как результат адаптации балтийского имени, а не немецкой фамилии.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России. Встречается в Псковской, Новгородской и Ленинградской областях — это как раз зона активных контактов с балтийскими языками. Сословного барьера у неё не было: Прауниными могли быть и крестьяне, и мещане, и отставные солдаты, получившие фамилию по прозвищу отца. Спорных версий здесь немного, и литовская этимология выглядит наиболее естественной, объясняя и звучание, и ареал бытования.