Фамилия Пресыпкин — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия, а бытовое прозвище, связанное с едой. Корень здесь — глагол «пресыпать» (насыпать сверх меры, пересыпать) или существительное «пресыпка» (что-то, чем пересыпают, например, муку или крупу). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Пресыпкин — буквально «сын или потомок Пресыпки». Модель образования типична для русских фамилий от прозвищ на -а/-я: Пресыпка → Пресыпкин.

Вероятнее всего, прозвище Пресыпка получил человек, который при пересыпании зерна или муки был неаккуратен, сыпал лишнее, либо, наоборот, тот, кто ведал мерой сыпучих продуктов — например, на мельнице или в амбаре. В крестьянском быту такие прозвища давались по заметной привычке или занятию, и они быстро закреплялись за родом. Вторая, менее вероятная версия — связь с диалектным «пресыпать» в значении «перебивать, перемежать» (например, речь прибаутками), но она не находит надёжного подтверждения в ономастических словарях.

Фамилия не относится к числу распространённых: по данным переписей, Пресыпкины встречаются в основном в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской и Тамбовской губерниях, где традиционно было развито зерновое хозяйство. Это косвенно подтверждает «сыпучую» версию происхождения.

В отличие от фамилий от канонических имён (Иванов, Петров), Пресыпкин сохранил в себе отпечаток конкретного действия — и это делает её историю более осязаемой. Никакой знати или громких титулов за ней не числится, но для понимания быта русского крестьянина XIX века такая фамилия говорит больше, чем иной дворянский герб.