Фамилия Придурковатин — редкий случай, когда словообразовательная модель «выдаёт» происхождение почти без загадок. Основа здесь — прилагательное «придурковатый», то есть «слегка глуповатый, недалёкий». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Придурковатин буквально значит «сын придурковатого» или «человек из семьи Придурковатого».

В русской ономастике фамилии на -ин обычно образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я (ср. Пушкин, Репин). Но здесь мы видим редкий случай: основа «придурковат» — это полное прилагательное с суффиксом -оват-, которое само по себе уже содержит оценку. Такие фамилии — «говорящие» прозвища, которые давали не в официальных документах, а в быту, в узком кругу. Человек мог получить прозвище Придурковатый за неловкость, чудачество или простодушие, а его дети уже стали Придурковатиными.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где суффикс -оват- в прозвищах встречается чаще, чем на севере. Встречаются варианты написания: Придурковатов (с мужским окончанием -ов) и Придурковатинов (с двойным суффиксом). Первый вариант логичнее: если прозвище было Придурковатый, то фамилия по отцу могла звучать как Придурковатов. Но закрепился именно Придурковатин — возможно, под влиянием диалектного произношения, где «атый» переходило в «атин».

Никаких дворянских корней у фамилии нет — это стопроцентно крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали без обиняков. В дореволюционных переписях она не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении (вероятно, вторая половина XIX века) и крайней локальности. Сегодня носители встречаются в основном в Воронежской и Ростовской областях, а также на Кубани.

Стоит предостеречь от попыток искать в фамилии иноязычный корень — например, связывать с немецким или тюркским «придур»: это чисто русское образование, построенное по продуктивной модели с суффиксом субъективной оценки.