Фамилия Пртодьяконов — редкий случай, когда ошибка в написании закрепилась в официальном родовом имени. Перед нами не что иное, как искажённая форма фамилии Протодьяконов, где первый слог «про-» превратился в «пр-». Такое упрощение, скорее всего, произошло из-за неграмотности писцов или особенностей местного говора: безударный гласный «о» редуцировался, и на письме его перестали обозначать. В результате мы имеем фамилию, которая по сути является усечённым вариантом, но при этом сохраняет ту же смысловую нагрузку.

Основа фамилии — церковный чин «протодьякон» (от греч. «протос» — первый и «диакон» — служитель). Протодьякон — это старший дьякон в соборе, который руководит другими дьяконами и часто отличается сильным голосом и особыми обязанностями при богослужении. Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Пртодьяконов — буквально «сын протодьякона» или «человек из семьи протодьякона». В Российской империи такие фамилии часто давали детям церковнослужителей, особенно в среде духовенства, где сан передавался по наследству или закреплялся за родом.

Географически фамилия встречается крайне редко, и её носители, вероятно, сосредоточены в центральной России или Поволжье — регионах с сильными церковными традициями. Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Дьяконов, Протодиаконов или Поддьяконов, показывает, что Пртодьяконов — аномалия, возникшая из-за случайности. В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна) подобные случаи «проглатывания» слогов описываются как типичные для фамилий, записанных со слуха.

Таким образом, носитель фамилии Пртодьяконов может с уверенностью считать, что его предки были связаны с церковной иерархией, а сама фамилия — живое свидетельство того, как устная речь влияла на письменные документы в прошлом.