Фамилия Прядунец — редкий пример того, как «женское» по сути ремесло оставило след в мужском прозвище, а затем и в фамилии. В её основе лежит прозвище Прядун, которое образовано от глагола «прясть» (в диалектной форме «прять»). Прядуном называли мужчину, который либо сам искусно прял нити, либо, что более вероятно, изготавливал прялки и другое оборудование для прядения. Прядение нитей традиционно считалось женским занятием, поэтому прозвище, данное мужчине, скорее всего, указывало не на домашний промысел, а на профессиональное мастерство: такой человек мог быть ремесленником, делавшим прялки, или владельцем прядильной мастерской.

Словообразовательная модель фамилии необычна. Суффикс -ец в русских фамилиях встречается реже, чем привычные -ов или -ин, и обычно указывает на принадлежность к определённой местности или группе людей («псковитянин», «казанец»). Здесь же суффикс -ец выполняет другую роль: он присоединяется к основе Прядун- и образует отчество-патроним, то есть «сын Прядуна». Со временем форма Прядунец закрепилась как фамилия, передающаяся по наследству. Интересно, что в некоторых говорах суффикс -ец мог также придавать слову уменьшительно-пренебрежительный оттенок, но в данном контексте он скорее маркирует потомка конкретного человека, чем мастера.

Среди однокоренных фамилий — Прядунов, Прядильщиков, Пряхин — форма Прядунец выделяется своей архаичностью и региональной окраской. Если фамилии на -ов и -ин массово закрепились в центральной России в XVI–XVII веках, то патронимы на -ец чаще встречались на северо-западе, в новгородских и псковских землях, а также в белорусском и украинском пограничье. Это позволяет предположить, что предки Прядунцов могли жить именно там, где прядение льна и конопли было главным крестьянским промыслом.

Точных сведений о сословной принадлежности первых носителей фамилии нет. Однако сам характер прозвища говорит о том, что его обладатель не принадлежал к дворянству: прядение и изготовление прялок — занятия посадских людей, ремесленников или зажиточных крестьян. В документах XVII–XVIII веков такая фамилия могла фиксироваться в формах Прядунец, Прядунцов или Прядунцев в зависимости от того, как писарь передавал на письме живое произношение.

В современном написании фамилия сохраняет ударение на втором слоге — Прядунéц, что тоже указывает на её происхождение от прозвища, а не от нарицательного слова. Потомки Прядуна, вероятно, и не подозревают, что их фамилия хранит память о ремесле, которое кормило семью несколько столетий назад.