Фамилия Пшунова — женская форма фамилии Пшунов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Пшун. В основе лежит корень «пшун-», который восходит к южнорусским и украинским говорам. Глагол «пшунить» или «пшукать» в диалектах означал «ворчать», «брюзжать», «говорить невнятно» или «пыхтеть». Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, отличался ворчливым нравом или имел привычку что-то бормотать себе под нос.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ов- указывает на принадлежность (чей сын? — Пшунов). Это типичный патроним, то есть фамилия по отцу. В русской ономастике фамилии на -ов/-ев чаще всего возникали в среде крестьян и мещан в XVI–XIX веках, когда прозвище главы семьи переходило на детей и закреплялось в документах.

Интересная деталь: в отличие от более распространённых фамилий на -ин (типа Пушкин, где основа на -а/-я), Пшунова стоит в ряду фамилий от основ на твёрдый согласный. Это сразу отсекает версию о связи с «пшеницей» — в таком случае мы бы имели Пшеницын или Пшеничников. Корень «пшун» не имеет отношения к злакам, он чисто звукоподражательный или характеризующий.

Встречается фамилия неравномерно: по данным открытых источников, наибольшая концентрация носителей — в Краснодарском крае и Ростовской области, что подтверждает южное происхождение корня. В центральных и северных регионах России она редка. Спорных версий происхождения практически нет — все лингвисты сходятся на диалектном глагольном корне. Если и была вторая версия (от тюркского «пшун» — «котёл» или «очаг»), она слабо подтверждена документально и не объясняет суффиксальную модель.

Таким образом, предки современных Пшуновых — скорее всего, крестьяне или казаки юга России, получившие прозвище по речевой манере или характеру. Фамилия недворянская, не связана с известными историческими родами, но сохранила живую диалектную черту, которая сегодня почти утрачена в речи.