Фамилия Пукино — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает все прочие версии. В русской ономастике фамилии на -ино (Пукино, Кузино, Тагино) типичны для центральных и северных областей России и означают «чей?» — то есть указывают на принадлежность к человеку по имени или прозвищу Пук. Но здесь есть нюанс: Пукино — это ещё и название нескольких реальных деревень, например, в Ивановской и Костромской областях. Поэтому, скорее всего, фамилия образована не напрямую от прозвища, а от топонима: предок получил её по названию места, откуда был родом, — «выходец из Пукина».

Корень «пук-» в русских говорах многозначен. В словаре Даля «пука» — это не только «пучок» или «связка», но и диалектное слово для обозначения горохового стебля. В некоторых регионах «пука» могло быть прозвищем человека маленького роста или, наоборот, того, кто носил что-то в связке, вязанке. Есть и более прозаичная версия: в псковских и тверских говорах «пукать» означало «стучать, колотить» — отсюда прозвище могло закрепиться за плотником или бондарем.

Суффикс -ин в фамилии Пукино указывает на притяжательную форму: изначально это было «Пукино село» или «Пукина деревня». Но в фамильном варианте окончание -о (а не -а) — характерный признак среднего рода, что и закрепилось в документах как неизменяемая форма. Это типично для фамилий, произошедших от названий сёл: если человек писался «Пукино», это почти всегда означало, что его предки были крестьянами из конкретного населённого пункта, а не просто «сыном Пуки».

Встречаемость фамилии крайне низкая. Она не фиксируется в массовых списках российских фамилий, таких как словарь Унбегауна, и не имеет известных дворянских ветвей. Поиск по базам данных показывает единичные случаи в центральной России, что подтверждает версию о локальном, деревенском происхождении. Если ваши предки носили Пукино, стоит искать корни в карте малых деревень Ивановской или Костромской области — именно там могли быть те самые Пукины, чьё название перешло в фамилию.