Фамилия Пукирин — редкий случай, когда основа настолько неочевидна, что без привлечения диалектной лексики не обойтись. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не «пук» и не «пукир», а скорее всего, глагол «пукать» — в северных и уральских говорах это означало «издавать глухой звук, хлопать, стрелять», а также «трескаться, лопаться от мороза» (о дереве или коже). Человек, получивший прозвище Пукиря, мог быть шумливым, резким в движениях, либо заниматься ремеслом, связанным с раскалыванием, рубкой или стрельбой.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Пукирин — буквально «сын Пукири». Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (Пукиря → Пукирин). В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от полных имён или названий животных, -ин тяготеет к личным прозвищам, особенно в северной и сибирской традиции. Если бы фамилия была тюркского происхождения, мы бы увидели основу «пукыр» (горбатый, кривой), но для русского уха такое объяснение менее естественно — в документах XVI–XVII веков на Русском Севере фиксируются прозвища Пук, Пука, Пукарь, что подтверждает славянскую версию.

Географически фамилия тяготеет к Вятке, Пермскому краю и Удмуртии — регионам, где говор сохранил слово «пукать» в значении «трескаться». Не исключено, что предок Пукирин был бондарем или плотником, работавшим с сырой древесиной, которая при усушке давала трещины (пукала). В метрических книгах XIX века Пукирины встречаются среди государственных крестьян — сословия, которое не знало крепостного права и часто занималось отхожими промыслами, лесозаготовкой и охотой.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от имени Пукыр — уменьшительной формы от Пукир, которое в свою очередь восходит к церковному имени Прокопий или Порфирий через просторечное сокращение. Но в этом случае мы бы ожидали форму Пукиров, а не Пукирин, так как суффикс -ин нехарактерен для имён на -ий. Поэтому прозвищное происхождение остаётся основным.

В XX веке фамилия не получила широкого распространения за пределами исходного ареала, что говорит о её локальном характере. Пукирины — это, скорее всего, потомки одного рода из северного Прикамья, чьё прозвище закрепилось в документах при переписях XVIII века. Сегодня носителей фамилии немного, и большинство из них по-прежнему живёт в Кировской области и Пермском крае.