Фамилия Пупердосова звучит настолько необычно, что первая мысль — перед нами позднее искусственное образование или искажение. Однако, если отбросить комичный оттенок, который возник в современном языке, и обратиться к диалектной лексике, картина становится яснее. Основа фамилии — прозвище Пупердос, а суффикс -ов- указывает на стандартный патроним: «чей?» — Пупердосов, то есть сын или потомок Пупердоса.

Что могло означать это прозвище? В русских народных говорах, особенно северных и уральских, слово «пупер» (или «пупёр») фиксировалось в значении «пузырь», «нарыв», «шишка» или «ком». Вторая часть — «дос» — скорее всего, не самостоятельный корень, а окончание, возникшее в результате переосмысления. Вероятнее всего, исходная форма — Пупырдос, где «пупыр» — вариант того же «пупырь» (волдырь, прыщ). Со временем «пупыр» могло перейти в «пупер» под влиянием аканья или просторечного произношения. Таким образом, Пупердос — человек с заметной кожной отметиной, родинкой или шишкой, либо же прозвище, данное в насмешку.

Фамилия редкая и явно недворянская. Её носители, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Географически стоит искать фамилию в регионах, где было распространено слово «пупырь» — это Архангельская, Вологодская, Пермская губернии, а также Поволжье. Модель образования на -ов типична для великорусских фамилий, окончательно закрепившихся у крестьян после отмены крепостного права в 1861 году. Версия о том, что фамилия могла возникнуть из прозвища, связанного с ремеслом (например, пупер — «надуватель» или «пустозвон»), менее убедительна из-за отсутствия устойчивой лексической параллели.

Стоит отметить, что в современных базах данных фамилия Пупердосова встречается единично. Очевидно, что она не прошла через литературную обработку и сохранилась в народной среде в своём первоначальном, диалектном облике. Это не искажение иностранной фамилии и не канцелярская ошибка — это прямое отражение живого простонародного прозвища, которое в XIX веке закрепилось как фамилия.