Фамилия Пуперов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, не связано с профессией, внешностью или характером, а отсылает к неожиданному бытовому контексту. Разберём её по косточкам.

Корень «пупер» скорее всего восходит к диалектному или просторечному слову «пуп» — пупок, пуповина. В говорах «пупером» могли называть человека с заметным, выпирающим животом, либо того, кто родился с особенностью пупка (например, пупочная грыжа). Прозвище Пупер — типичный пример народной меткой характеристики, которая закреплялась за человеком в небольшой деревне или слободе. Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей сын?» — Пуперов, то есть потомок Пупера.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с глаголом «пупить» (надувать, топорщить). В этом случае Пуперов мог быть прозвищем надутого, важного или обидчивого человека. Третья гипотеза — заимствование из западных языков, например, от немецкого Puppe (кукла) или французского poupée, но для русской глубинки это маловероятно: фамилия Пуперов почти не встречается в дворянских родословных и явно крестьянского или мещанского происхождения.

Географически фамилия редкая и локальная. Основные следы ведут в центральные и южнорусские области — Тамбовскую, Воронежскую, Рязанскую губернии, где диалектная лексика с корнем «пуп» была особенно активна. Встречается также в старых переписях казачьих станиц, что подтверждает народное, а не искусственное происхождение.

Интересная деталь: однокоренные фамилии Пупов, Пупин, Пупанов встречаются чаще, а Пуперов стоит особняком из-за редкого суффикса -ер. Этот суффикс в русских прозвищах нехарактерен (обычно -ун, -ак, -ан), что делает фамилию Пуперов своеобразным диалектным уникумом — возможно, местным вариантом слова «пупень» или «пупок» с искажением на слух.