Фамилия Пущеенко — яркий пример украинской модели фамильного словообразования. Суффикс -енко, характерный для Поднепровья и Левобережной Украины, указывает на происхождение от отца: буквально «маленький Пущей» или «сын Пущи». Такие фамилии закрепились в XVI–XVII веках и со временем перестали быть уменьшительными, став наследственными. Основа фамилии — прозвище Пуща — вызывает два основных толкования.

Первое и самое прямое: «пуща» в славянских языках — это густой, труднопроходимый лес, чаща. Прозвище Пуща могли дать человеку, жившему в лесной глуши, леснику, охотнику или смолокуру. Второе, менее очевидное значение, связано с диалектным глаголом «пущать» (пускать). В этом случае Пущей могли прозвать расторопного, «распущенного» в делах человека или, наоборот, того, кто не держал скотину взаперти. В пользу первой версии говорит устойчивая ассоциация фамилии с лесным промыслом.

С фамилией Пущеенко связана одна редкая деталь — двойное -ее- в корне. В украинском языке слово «пуща» произносится с твёрдым «щ», и суффикс -енко присоединяется без изменений. Однако в русской записи фамилии появилось удвоение гласной, которое встречается лишь в нескольких десятках фамилий (например, Защеенко, Лещеенко). Это могло возникнуть из-за того, что писцы на слух различали долгий мягкий звук и передавали его как «ще» с двумя «е» — своеобразная гиперкоррекция. В любом случае, написание через «ее» закрепилось и стало отличительным признаком рода.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям Украины — Черниговщине, Сумщине, Полтавщине, где леса когда-то были основным ландшафтом. В России Пущеенко встречаются редко, чаще всего это потомки переселенцев конца XIX — начала XX века. Сословный состав предков определить сложно: среди казаков и крестьян фамилия могла появиться у любого, кто получил прозвище от места жительства или занятия. Дворянских родов с такой фамилией в официальных родословных книгах не зафиксировано.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Пуща, Пущин, Пущенко — показывает, что Пущеенко стоит особняком. Если Пущин — это типичная русская фамилия с суффиксом принадлежности -ин, а Пущенко — упрощённый украинский вариант, то Пущеенко сохранила архаичное удвоение, которое в XX веке часто утрачивалось при смене документов. Так что носители фамилии могут быть уверены: их фамилия — не опечатка, а редкий лингвистический след, застывший в паспорте.