Фамилия Пылипака — редкая и звучит не по-русски. Её происхождение почти наверняка украинское или белорусское, и разгадка кроется в суффиксе и ударении. Если ударение падает на последний слог — «Пылипака́», то перед нами типичная южнорусская или украинская модель фамилий на -ака/-яка. Такие фамилии часто имели прозвищный характер и образовывались от глаголов или имён с экспрессивным оттенком: «гуляка», «кривляка», «забияка». В основе «Пылипака» лежит, скорее всего, имя Филипп (в украинском произношении — Пилип). От него образовали прозвище Пылипака — то есть «Филиппка», но не уменьшительно-ласкательное, а с оттенком фамильярности или даже пренебрежения: этакий Филипп, которого не уважают, а зовут вполголоса или с насмешкой.

Есть и другая версия, менее вероятная. В некоторых говорах «пылить» означало «бить», «колотить», а «пылипака» могло быть прозвищем драчуна или задиры. Однако связь с именем Филипп выглядит прочнее: в украинских фамилиях на -ака от имён встречаются Пилипака, Грицака (от Григорий), Иванака. Фамилия Пылипака — это, скорее всего, украинский вариант, где начальное «Пы-» возникло из-за аканья или диалектного произношения (вместо «Пилипака»).

Географически фамилия тяготеет к западу Украины и югу Беларуси. В дореволюционных списках она не встречается — это говорит о том, что носители были из крестьян или мещан, не имевших закреплённой фамилии до XIX века. Сословный потолок у фамилии низкий: дворян среди Пылипак не было. Сегодня она остаётся крайне редкой, и каждый её носитель может с высокой долей уверенности считать, что его предок — тот самый Пилип, чьё имя обросло прозвищем и со временем стало фамилией.