Фамилия Пынра — редкий случай в русском ономастиконе. Она не укладывается в привычные словообразовательные модели на -ов, -ин или -ский. Её основа не имеет очевидных параллелей в славянских языках, что сразу указывает на иноязычное происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая в результате адаптации нерусского прозвища или географического названия.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с финно-угорскими языками, распространёнными на северо-западе и севере России. В коми-пермяцком языке есть слово «пын» — «губа», а в некоторых диалектах «пынра» может означать «губастый» или «толстогубый». Прозвища по внешним признакам — обычное дело при образовании фамилий. Носитель такого прозвища мог получить его за характерную форму губ. В пользу этой гипотезы говорит и типичный для коми фамильный суффикс -а, который часто застывал в неизменной форме при русификации. Если это так, то фамилия Пынра — это не что иное, как застывшее прозвище, перешедшее в паспортное имя без дополнительных русских окончаний.

Другая, менее вероятная гипотеза — связь с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках «пын» или «бун» означает «рана», «язва». Тогда «Пынра» могло бы означать «раненый» или «больной». Однако эта версия слабее: тюркские прозвища обычно давали по более ярким социальным или физическим признакам, а не по временным состояниям, и в русских фамилиях они редко встречаются без типичных суффиксов.

География фамилии сегодня размыта — носители встречаются в разных регионах России, но из-за редкости составить чёткую картину расселения сложно. Фамилия не попала ни в какие массовые перечни, её нет в известных дореволюционных справочниках. Это говорит о том, что род Пынра, скорее всего, был немногочисленным, возможно, крестьянским или мещанским, и не оставил заметного следа в документах XIX века.

Если отталкиваться от версии с коми-пермяцким корнем, то предки носителя фамилии жили на территории современного Пермского края или Коми. Они могли быть охотниками, рыбаками или земледельцами, а прозвище «Пынра» — «губастый» — дали кому-то из них, и оно закрепилось за родом. Фамилия Пынра — пример того, как местное, диалектное слово, не имеющее аналогов в литературном русском языке, становится родовым именем, сохраняя память о языке и быте небольшого народа.