Фамилия Пынтикова — женская форма фамилии Пынтиков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Пынтя. Сразу стоит оговориться: корень здесь не прозрачный, и этимология не лежит на поверхности. В русской ономастике такие фамилии часто относят к разряду «тёмных», то есть не имеющих однозначного толкования в рамках великорусского лексикона.

Самая вероятная версия связывает основу «пынт-» с диалектными словами. В южнорусских и украинских говорах «пынтя» или «пындык» могло означать нечто вроде «брюшко», «пузо», «толстяк» — то есть прозвище по внешнему признаку. Слово могло звучать как «пеньтя» или «пендюх», но с характерной для некоторых регионов заменой «е» на «ы». В этом случае предок-носитель фамилии был человеком плотного телосложения, возможно, медлительным и основательным.

Вторая, менее распространённая гипотеза — связь с тюркскими корнями, например, с татарским «пынтык» (приземистый, коренастый) или «бенде» (раб, слуга — в искажённом произношении). Однако для фамилии с суффиксом -ов, типичным для центральной России, тюркское происхождение маловероятно: такие заимствования обычно оставляют более узнаваемый след (как Булгаков или Карамзин). Скорее всего, Пынтиковы — это исконно русская фамилия, возникшая в крестьянской или мещанской среде где-нибудь в Тамбовской, Рязанской или Воронежской губерниях, где диалектная лексика была особенно богата.

Суффикс -ик в основе (Пынт-ик-ов) указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму: Пынтя — Пынтик. То есть прозвище было не официальным, а домашним, уличным. Фамилия редкая, в списках массовых не значится, что говорит о её локальном происхождении: носители, скорее всего, потомки одной семьи или нескольких родственных родов из одного уезда.