Фамилия Пырцева — женская форма фамилии Пырцев, а та, в свою очередь, образована от прозвища Пырец. В основе этого прозвища, скорее всего, лежит слово «пырей» — всем известный сорняк с длинным ползучим корневищем. Прозвище Пырец могли дать человеку за какую-то внешнюю или внутреннюю черту, напоминающую это растение: например, за худобу и жилистость, за цепкость и «живучесть», или же за то, что он, подобно пырею, был настырным и пронырливым. В русских говорах слово «пырей» имело и переносные значения: так могли назвать бойкого, подвижного человека.

Модель образования фамилии проста и типична для русского ономастикона: прозвище Пырец, оформленное притяжательным суффиксом -ев, дало фамилию Пырцев. Суффикс указывает на принадлежность: «сын Пырца» или «из семьи Пырца». Ударение в фамилии чаще всего падает на первый слог — Пырцева, хотя в некоторых говорах возможно смещение.

Менее вероятна, но не исключена версия, что в основе лежит не прозвище, а мирское имя Пырец. В дохристианской Руси были распространены имена, образованные от названий растений (Трава, Былина, Лопух), и Пырец могло быть таким охранительным именем. Его давали, чтобы ребенок рос здоровым и цепким за жизнь, как сорняк.

Фамилия Пырцева встречается нечасто, что говорит о её локальном происхождении. Основные очаги бытования, судя по открытым данным, — Нижегородская область и южные регионы России. Встречается она и на Украине, что может быть связано с переселением крестьян в XIX–XX веках. В дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована, что указывает на её крестьянские или мещанские корни: предки носителя фамилии были, скорее всего, землепашцами или ремесленниками, а прозвище закрепилось за их родом в среде сельской общины.