Фамилия Рабатуев — редкий случай, когда основа слова не имеет очевидных параллелей в русском языке. В ней нет корней, связанных с ремёслами, животными или распространёнными прозвищами, что сразу заставляет искать объяснение в диалектах, заимствованиях или искажённых формах других фамилий.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Рабатуев — сын или потомок человека по прозвищу Рабатуй. Само прозвище, скорее всего, имеет тюркские корни. В ряде тюркских языков основа «рабат» (или «рават») означает «укрепление», «постоялый двор» или «монастырь». В таком случае Рабатуем могли называть человека, жившего при подобном строении, сторожа или смотрителя. В русских говорах Поволжья и Приуралья, где исторически было сильное татарское и башкирское влияние, такие прозвища не редкость.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским словом «раббат» (связывающий, укрепляющий) через посредничество исламской традиции. Однако для русской фамилии это слишком книжный путь, маловероятный в крестьянской среде.

Географически фамилия Рабатуев встречается крайне редко. Основные очаги — южные регионы России, особенно Ростовская область и Краснодарский край, а также единичные случаи в Западной Сибири. Это говорит о том, что фамилия не получила широкого распространения и, вероятно, осталась локальной, характерной для одной-двух семейных ветвей.

В написании фамилии обращает на себя внимание окончание -уев, что нетипично для русских фамилий от тюркских основ (обычно -ов: Рабатов). Это может быть следствием диалектного произношения или, напротив, более точной передачи исходного слова. В любом случае, носитель фамилии Рабатуев с высокой долей вероятности имеет предков, связанных с тюркоязычной средой или русско-тюркским пограничьем, где подобные прозвища возникали естественным путём.