Фамилия Рафольский — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности, что делает разбор особенно интересным. Скорее всего, перед нами фамилия польского или западнорусского происхождения, образованная по географической модели с суффиксом -ский. Этот суффикс указывал на связь с местностью: владельческий или дворянский статус, либо просто на выходца из определённого селения.

Основа «Рафоль-» почти наверняка восходит к личному имени Рафаил (из древнееврейского «Бог исцелил»). В просторечии имя Рафаил давало множество форм: Рафал, Рафаля, Рафоль. В польском языке имя звучит как Rafał, и от него образована фамилия Rafalski. Рафольский — это, по сути, фонетическая или орфографическая русификация польского Rafalski. Фамилия могла возникнуть, когда носитель переехал на восток, в земли бывшей Речи Посполитой, где польское «а» в безударном положении стали произносить как «о» (аканье) и записывать на русский лад.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с топонимом. В Польше и на западе современной Беларуси существовали и существуют мелкие хутора или урочища с корнем «Рафол-» (например, Рафолово). В таком случае фамилия Рафольский — типичный пример фамилии, данной по названию имения или деревни, откуда человек был родом. Но если эта фамилия и топонимическая, то первичным названием места всё равно послужило то же имя Рафаил.

О сословной принадлежности носителей судить трудно. Суффикс -ский в XVIII–XIX веках был распространён и среди шляхты, и среди духовенства, и среди крестьян, получивших фамилии при переписях. Однако сама редкость фамилии и её польский оттенок могут указывать на шляхетское происхождение предков, которые после разделов Польши оказались в черте оседлости Российской империи. В любом случае, корень у Рафольского один — библейское имя Рафаил, прошедшее через польскую языковую среду.