Фамилия Рафтопуло — редкий для России случай греческого происхождения. Её основа — слово «рафтис» (ράφτης), что по-гречески означает «портной», а суффикс «-пуло» (πουλο) — уменьшительный или патронимический, характерный для греческих фамилий, особенно с Понта и островов. Буквально Рафтопуло — «сын портного» или «портняжка». В греческой ономастике такие фамилии на «-пуло» (иногда «-пулос») распространены в северной Греции, Малой Азии и среди понтийских греков. В Российскую империю фамилия попала, скорее всего, с переселенцами из Османской империи, особенно в XIX веке, когда греки активно селились в Одессе, Мариуполе, Таганроге и на Кавказе.

Словообразовательная модель здесь не славянская, а греческая: корень «рафт-» (шитьё) + суффикс принадлежности. В русском языке фамилия сохранила исходное греческое окончание, не получив типичных русских суффиксов «-ов» или «-ин». Это указывает на то, что носители долго сохраняли этническую идентичность и не русифицировали фамилию. Аналогов по модели в русском языке почти нет — можно вспомнить разве что фамилии вроде «Карапуло» или «Христофоропуло», но все они тоже греческие.

Географически Рафтопуло встречается в южных регионах России (Краснодарский край, Ростовская область) и в Украине, особенно в бывших греческих колониях Приазовья. В Греции фамилия Рафтопулос (с окончанием «-ос») довольно известна, но в русской записи потеряла последний слог. Споров о происхождении практически нет: версия с «портным» — единственная убедительная, альтернативы (например, от турецкого слова) лингвистически слабы и не подтверждаются греческой лексикой. Таким образом, предки носителя фамилии Рафтопуло с высокой вероятностью были портными или происходили из семьи портного, сохранив в фамилии память о ремесле и греческих корнях.