Фамилия Ракома — редкий случай, когда географическое название стало родовым именем. В основе лежит топоним Раком: так называется древнее село под Новгородом, известное с XII века. По преданию, здесь князь Ярослав Мудрый одержал победу над войском Святополка Окаянного, и название связывают с финно-угорским корнем raka — «раковина» или «ракушка», что могло указывать на особенности местного рельефа или почвы. Фамилия образована по простой и типичной для русского Севера модели: от названия местности с помощью суффикса -а, который в данном случае закрепился в форме Ракома без дополнительных патронимических окончаний. Такое явление — «застывшая» основа без -ов/-ин — встречается у фамилий, которые возникли из прозвищ по месту жительства: человека, выходца из Ракома, земляки могли называть просто Ракома, и это прозвище со временем стало наследственным.

Возможна и другая, более прозаичная версия. В новгородских говорах слово «раком» означало «на спине», «вверх ногами» — от наречия «раком» (как рак). Прозвище Ракома могли дать человеку с необычной походкой, сутулого или того, кто любил ходить задом наперёд в играх или работе. Однако географическая привязка к конкретному селу кажется более убедительной: фамилия почти не встречается за пределами Новгородской области и соседних районов, что указывает на локальное происхождение от одного поселения.

В отличие от массовых фамилий на -ов, Ракома сохранила архаичную форму, характерную для северных и псковских земель, где в XVI–XVII веках прозвища часто переходили в фамилии без изменений. Носители этой фамилии, скорее всего, потомки крестьян или ремесленников из окрестностей Новгорода, которые получили фамилию по названию родной деревни. В дореволюционных метрических книгах Ракома встречается эпизодически, и сегодня это одна из редких русских фамилий, чья история укладывается в границы одного исторического региона.