Фамилия Ракшеева — женская форма фамилии Ракшеев, и её происхождение стоит искать не в очевидном «раке», а в старом русском прозвище или имени. Скорее всего, в основе лежит слово «ракша» — так в южных и центральных говорах называли птицу-сойку, а также иногда — болтливого, крикливого или пёстро одетого человека. Прозвище Ракша могли дать за яркую внешность, громкий голос или привычку пересмеивать, подражать другим — сойка ведь известна способностью копировать чужие звуки.

Модель образования фамилии типична для русской аристократии и крестьянства XVI–XVII веков: суффикс -ев присоединялся к основе на мягкий согласный или шипящий (Ракш- → Ракшев). Форма на -ева указывает на принадлежность роду Ракшеевых — жена, дочь или вдова Ракшея. Встречается и вариант Ракшин, где суффикс -ин указывает на основу «Ракша» как на существительное женского рода, но Ракшеев — более распространённая модель.

Географически фамилия Ракшеев (и Ракшеева) тяготеет к Поволжью и Уралу: в документах XVII–XVIII веков упоминаются крестьяне и посадские люди с этим прозвищем в Казанском, Симбирском и Вятском уездах. Встречается и в среде старообрядцев — вероятно, из-за того, что прозвище не несло церковной окраски и бытовало в быту. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» пример Ракшеев не разбирается отдельно, но типологически он близок к фамилиям от названий птиц (Сорокин, Воробьёв, Галкин) — с той разницей, что «ракша» как диалектизм реже попадала в официальные записи.

Есть и другая, менее вероятная версия: от тюркского имени Ракыш (или Ракша) — со значением «молния» или «быстрый». Но в русской среде фамилия оформлена славянским суффиксом, а не тюркским окончанием, так что версия с сойкой и прозвищем остаётся основной. Носительница фамилии Ракшеева может с уверенностью считать, что её предок — человек, которого за яркость или голос прозвали Ракшей, а потом это прозвище закрепилось за родом.