Фамилия Регистер — редкая для русского слуха, и её происхождение неочевидно. Скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная, что и определяет её историю.

Первый и самый вероятный путь — немецкий или еврейский (ашкеназский) корень. В немецком языке слово «Register» (Регистер) означает «реестр», «список», «журнал записей» или «регистр» (в музыке или технике). Фамилию могли дать человеку, чья профессия была связана с ведением записей: писарю, секретарю, чиновнику, который вёл реестры, или, возможно, церковному регистратору. В среде еврейских общин Восточной Европы (территории бывшей Речи Посполитой, Австро-Венгрии) фамилии, образованные от названий профессий или должностей, были очень распространены в конце XVIII — начале XIX века, когда власти ввели обязательную фиксацию фамилий. Таким образом, предок носителя фамилии Регистер мог быть «регистратором» в магистрате, канцелярии или общине.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная для русского контекста, — это вариант фамилии Регистров или Регистровский. Суффикс -ер в русском языке нехарактерен для образования фамилий от профессий (обычно это -ов/-ев, -ин). Поэтому фамилия Регистер почти наверняка пришла в готовом виде из немецкоязычной или польско-еврейской среды. В польском языке слово «regestr» (старое написание) означало то же самое — реестр, список.

Третий, совсем редкий вариант — происхождение от латинского «regesta» (записанное, перечень) через посредничество немецкого. Но это лишь подтверждает общую канцелярскую природу названия.

Географически фамилия Регистер чаще всего встречается на западе Украины, в Беларуси, а также в Германии и у потомков эмигрантов в США. В России она редка, что подтверждает её «пришлый» характер. Носители этой фамилии, как правило, потомки либо немецких колонистов, приглашённых Екатериной II (ремесленники, чиновники, аптекари), либо еврейских жителей черты оседлости, получивших фамилию по роду занятий. В любом случае, основатель рода был грамотным человеком, имевшим дело с документами и учётом.