Фамилия Рлодугин — редкая и нестандартная по своему звучанию, что сразу наводит на мысль об искажении исходной формы. Скорее всего, перед нами не первоначальное написание, а результат описки или диалектного произношения, закрепившийся в документах. Вероятная основа — фамилия Рогодугин или Рылодугин, где корень связан с прозвищем человека по характерному действию или занятию.

Если исходить из модели «Рылодугин», то разбор очевиден: основа «рыло» (лицо, морда, а в переносном смысле — нос или передняя часть) плюс «дуга» (изогнутая часть упряжи, коромысло). Такое прозвище, «Рылодуга», могли дать человеку с крупным, горбатым или загнутым носом, напоминающим дугу. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Рылодуги, то есть потомок человека с таким прозвищем. Со временем «ы» могло перейти в «о» под влиянием акающих говоров (Рылодугин → Ролодугин → Рлодугин), либо буква просто выпала при записи.

Менее вероятна, но возможна версия происхождения от тюркского или финно-угорского корня, который в русском ухе переосмыслился как «Рлодугин». Например, в коми-пермяцком языке встречаются основы с сочетанием «рл», но подтверждений такой этимологии для данной фамилии нет. География бытования фамилии практически не изучена: в современных базах данных она встречается единично, в основном в центральных и северных областях России, что косвенно подтверждает версию о случайном искажении.

В любом случае, фамилия Рлодугин — яркий пример того, как живая речь и канцелярская ошибка могут создать уникальную форму. Носителю этой фамилии стоит обратить внимание на старые метрические книги: скорее всего, предки писались иначе, и первоначальный вариант (например, Рогодугин или Рылодугин) даст ключ к прозвищу родоначальника.