Фамилия Руанда — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с одноимённым африканским государством. Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от географического названия или прозвища, но не от экзотической страны, а от местного топонима.

Вероятнее всего, основа фамилии — название населённого пункта, например, деревни или урочища с корнем «руда» (от славянского «руда» — «кровь», «ржавчина» или «железная руда»). В русских говорах «руда» могла означать «болотистое место с рыжей водой» или «грязь, окрашенная окислами железа». Фамилия Руанда могла возникнуть как вариант фамилии Руда, Рудин или Руданский, но с изменённым окончанием под влиянием диалектного произношения или ошибки писаря. Суффикс -анда здесь нехарактерен для русских фамилий, что указывает на возможное западное или южнославянское влияние: в польском, украинском или белорусском языках такие окончания встречаются чаще.

Другая, менее вероятная версия — связь с личным именем Руан (редкое имя, возможно, от германского Hrod- «слава»), к которому добавился суффикс -да, но это объяснение искусственное, так как подобные модели в русской антропонимии почти не встречаются. Географически фамилия могла бытовать в регионах, где были деревни с названием Руда (в Беларуси, на Украине, в западных областях России), а её носители — выходцы из таких мест, получившие прозвище по месту жительства.

Таким образом, фамилия Руанда — не африканская, а славянская по корню, но редкая по форме. Её носители, скорее всего, потомки крестьян или мещан из западных губерний Российской империи, чья фамилия закрепилась в результате нестандартной записи или местного произношения.