Фамилия Руфеева — женская форма фамилии Руфеев, и её ключ к происхождению лежит не в славянском, а в церковном календаре. В основе лежит редкое крестильное имя Руф (от латинского rufus — «рыжий» или «красноватый»). В православных святцах это имя носили несколько раннехристианских мучеников, в том числе апостол от семидесяти Руф, упомянутый в Послании к Римлянам. Имя встречалось в России редко, поэтому и фамилии от него — штучный товар.

Модель образования стандартная: к основе Руф- добавили суффикс принадлежности -ев-, что в древнерусской традиции означало «сын Руфа» или «человек из семьи Руфа». Форма Руфеев (а не Руфов) могла возникнуть из-за того, что полное имя в быту произносили как Руфей — так мягкий звук на конце дал суффикс -ев, а не твёрдый -ов. Встречается и вариант Руфов, но Руфеев — более редкая и, возможно, более старая запись.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России, где старообрядцы и крестьяне дольше сохраняли редкие календарные имена. Встречается в Вологодской, Костромской и Ярославской областях, а также в Сибири, куда такие фамилии попали с переселенцами. Сословно носители — чаще всего крестьяне и мещане: имя Руф не было популярным в дворянской среде, и фамилия не обросла громкими титулами.

Спорных версий здесь немного. Иногда Руфеева пытаются связать с диалектным словом «руф» — так в некоторых говорах называли грубую ткань или мешковину. Но это маловероятно: прозвище от названия ткани дало бы форму Руфов или Руфин, а не Руфеев. Церковное происхождение надёжнее и подтверждается тем, что в метрических книгах XIX века имя Руф встречается именно у духовенства и крестьян, а не у ремесленников.

По суффиксу фамилия типична для русского Севера и Поволжья, где -ев часто заменял -ов после мягких согласных. Если ваш предок носил фамилию Руфеев, он почти наверняка был потомком человека, которого в церковных записях звали Руфом — и это имя, хоть и редкое, дало фамилию, не затерявшуюся в веках.