Фамилия Рухулин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного славянского суффикса -ов/-ев или -ин, который присоединяется к основе на согласную: здесь мы видим суффикс -ин, но основа «Рухул» звучит нетипично для русских имён и прозвищ. Это сразу указывает, что фамилия, скорее всего, не исконно русская, а образована от иноязычного имени или прозвища.

Самый вероятный корень — тюркский или арабский. Имя Рухул (Ruhul) может быть вариантом арабского «Рух» — дух, дыхание, или составной частью имени, например Рухулла (дух Аллаха). В тюркских языках, особенно у татар, башкир, народов Кавказа, такие имена были распространены. Суффикс -ин в русской фамилии указывает не на принадлежность к роду (как у славян), а на то, что фамилию дали по отцу: «сын Рухула». Для нерусских народов, вошедших в состав Российской империи, это типичная модель русификации фамилий — к местному имени добавляли русский суффикс.

Географически фамилия Рухулин тяготеет к регионам с тюркским или исламским населением: Татарстан, Башкортостан, Астраханская область, Северный Кавказ. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от конкретного рода или селения. В дореволюционных документах фамилия могла писаться иначе: Рухуллин, Рухулов, пока не закрепилось современное написание.

Альтернативная, но менее правдоподобная версия — связь с диалектным русским словом «рухлый» (рыхлый, непрочный) или «рухлядь» (старьё, хлам). Однако суффикс -ин тогда дал бы форму «Рухлин», а не «Рухулин», и такая фамилия встречается чаще. Появление гласной «у» в середине — явный признак заимствованной основы.

Итак, предки носителя фамилии Рухулин, скорее всего, были татарами, башкирами или представителями кавказских народов, носившими личное имя Рухул (или его вариант). После крещения или при переписи населения в XIX веке это имя превратилось в фамилию с русским окончанием. Род занятий по фамилии не определяется — она образована от имени, а не от профессии или прозвища.