Фамилия Рустамаева — женская форма мужской фамилии Рустамаев, а та, в свою очередь, образована от личного имени Рустам. Это имя восходит к герою персидского эпоса «Шахнаме» могучему богатырю Рустаму. В тюркских языках, особенно у народов Кавказа и Поволжья, имя Рустам стало чрезвычайно популярным, вытеснив мифологический подтекст и закрепившись как обычное мужское имя со значением «сильный», «могучий», «богатырь». Таким образом, фамилия Рустамаева в буквальном смысле означает «потомок (или жена) человека по имени Рустам».

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий, адаптированную к иноязычной основе. В данном случае к имени Рустам добавлен патронимический суффикс -ев (а не -ов, так как основа оканчивается на мягкий согласный). Это типичный пример того, как нерусские по происхождению имена «обрусевали» в XIX–XX веках при записи в метрические книги, паспорта и переписи населения. Фамилия распространена в регионах с тюркоязычным и ираноязычным населением: в Дагестане, Чечне, Татарстане, Азербайджане, а также среди таджиков и узбеков, где имя Рустам встречается особенно часто.

В отличие от многих русских фамилий, которые восходят к прозвищам или названиям ремесел, Рустамаева — фамилия «чисто» патронимическая, то есть указывающая на отца. Она не несет в себе сословной или профессиональной характеристики. Носительницы этой фамилии — потомки людей, которых в первом поколении звали Рустам. Написание фамилии строго фиксированное: с двумя «а» в корне (Рустам, а не Рустем) и окончанием -аева, что отличает ее от варианта Рустемова, который тоже встречается, но реже и характерен для крымско-татарской среды.

Интересная деталь: несмотря на то что имя Рустам — древнее и эпическое, фамилия Рустамаева — сравнительно молодая. Массово такие фамилии начали оформляться только в советское время, когда паспортизация затронула все народы СССР. Поэтому генеалогическое древо Рустамаевых, скорее всего, не уходит глубже середины XIX века.