Фамилия Рутштейн образована от аналогичного прозвища, которое является составным. Первая основа прозвища - «рут» - восходит к немецкому rute, что в переводе на русский язык означает «прут, розга». Вторая часть фамилии - «штейн» - произошла от нарицательного stein - «камень, кирпич». Вероятно, такое прозвище указывало на такие черты характера его обладателя, как жесткость, твердость, упорство и др. Можно предположить, что предок обладателя фамилии Рутштейн был либо пастухом, либо строителем.