Фамилия Сабайтис звучит для русского уха непривычно, и это прямой намёк на её происхождение. Это типичная литовская фамилия, образованная с помощью патронимического суффикса -айтис (-aitis). В литовской ономастике этот суффикс указывает на происхождение: буквально «сын такого-то» или «потомок». По аналогии с русскими фамилиями на -ов/-ев, Сабайтис означает «сын Сабаса» или «принадлежащий к роду Сабаса».

Основа фамилии — личное имя Сабас. В Литве это краткая форма от имени Себастьянас (литовский аналог Себастьяна) или же от крестильного имени Сабатий (Сабатий — греческое имя, означающее «субботний», от слова «саббатон»). Встречается и версия, что Сабас — это вариант библейского имени Савва. Какой бы вариант ни был верным, ясно одно: фамилия ведёт родословную от человека, которого в быту звали Сабасом.

Географически фамилия Сабайтис почти наверняка указывает на предков из Литвы, особенно из Жемайтии или Аукштайтии. В русскоязычной среде эта фамилия встречается редко и обычно появляется в результате миграции литовцев в регионы бывшей Российской империи или СССР. Интересно, что в русских документах XIX — начала XX века фамилию могли записывать иначе: Сабайть, Сабайтис, а иногда и русифицировать, добавляя окончание -ов (Сабайтов). Но исходная литовская форма сохранилась у тех, кто не утратил связь с национальными корнями.

Сословно носители фамилии Сабайтис чаще всего были крестьянами или мелкими ремесленниками. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — в шляхетской среде Литвы были распространены фамилии на -ич или -ский. Так что предки Сабайтисов — это простые люди, чья фамилия просто и честно сообщает, чьими они были детьми.