Фамилия Саетханова — женская форма, а её мужской вариант, Саетханов, образован по тюрко-персидской модели. В основе лежит сложное имя Саетхан, где первая часть «Сает» (арабское «саид») означает «господин», «предводитель», «счастливый», а вторая — «хан» (тюркское «властитель», «князь»). Соединение этих двух титулов в одном имени — характерная черта мусульманского именослова: так подчёркивали высокое происхождение или давали имя-пожелание, чтобы ребёнок вырос уважаемым и влиятельным.

Фамилия Саетханов (Саетханова) типична для татарской и башкирской ономастики, а также встречается у народов Кавказа (например, у кумыков). Если разбирать словообразовательную модель, то суффикс -ов здесь не славянский по происхождению — он был заимствован в русскую систему фамилий как стандартный способ русификации тюркских имён. В татарской среде такие фамилии на -ов стали массово появляться после XVI–XVII веков, когда начался учёт населения в документах Московского царства.

Интересная деталь: в некоторых говорах и диалектах «Сает» могло звучать как «Саит» или «Сагит», поэтому фамилия Саетханов — одна из многих однокоренных, наряду с Саитхановым или Сагитхановым. Разница в написании часто зависела от местной произносительной нормы и грамотности писаря. Встречается и вариант с двойным «т» — Саеттханов, но он редок.

Исходное имя Саетхан не было исключительно аристократическим — его давали и простым людям, надеясь на удачу. Поэтому предки носителей фамилии могли быть крестьянами, ремесленниками или торговцами, а не обязательно знатью. Достоверных сведений о сословном составе именно по этой фамилии нет, но общая картина по региону показывает, что большинство татарских фамилий на -ов закрепились за податными сословиями.

Сейчас фамилия Саетханова встречается в основном в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — там, где исторически компактно проживают тюркские народы.