Фамилия Саитханов — яркий пример тюрко-персидского влияния в русском ономастиконе, и её разбор стоит начать с имени-основы. В её основе лежит составное мужское имя Саитхан, которое, в свою очередь, распадается на два компонента. Первый — «Саит» (араб. سعيد, Саид), что означает «счастливый», «благополучный», «господин». Второй — «хан» (тюрк. «властитель», «князь»), титул, который в составе личных имён часто служил пожеланием знатности или почётным добавлением. Таким образом, имя Саитхан можно перевести как «счастливый господин» или «благополучный властитель» — типичная для Востока формула, сочетающая религиозный (исламский) и тюркский аристократический элементы.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: к основе на -х- добавляется русский патронимический суффикс -ов. В среде татар, башкир и других тюркоязычных народов Поволжья и Урала фамилии на -ов образовывались от имён отцов, и Саитханов — буквально «сын Саитхана». Это одна из самых распространённых моделей русификации имён в XIX–XX веках, когда фиксация фамилий стала обязательной. Суффикс -ан- в основе (Саитхан, а не Саитх) указывает на то, что имя бытовало именно в такой, полной форме, с сохранением тюркского титула.

Географически фамилия тяготеет к регионам компактного проживания татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается она и среди ногайцев, а также у народов Северного Кавказа, где имя Саид (Саит) в сочетании с титулом хана также было употребительно. В отличие от фамилий на -ин (типа Саитханов — редкий случай, так как основа оканчивается на согласную), или на -ский, Саитханов — типичный пример «второй волны» тюркских фамилий, которые не были адаптированы через прозвища, а напрямую калькировали отчество.

Спорных версий у этой фамилии практически нет: корень прозрачен, а альтернативное толкование (например, от прозвища Саитхан, означающего «человек, служащий у хана») маловероятно, так как имя Саитхан было личным, а не социальным ярлыком. В словарях тюркских имён (например, у Гафурова или Саттарова) имя Саитхан фиксируется как составное, и фамилия наследует его семантику без искажений.

Таким образом, носитель фамилии Саитханов может с высокой долей уверенности считать, что его предок носил имя, в котором соединились арабское понятие благодати и тюркское представление о власти. Это не ремесленная и не сословная фамилия, а чисто именная, указывающая на отца, который, судя по имени, был мусульманином и, возможно, происходил из среды, где титул «хан» был не просто формальностью, а знаком уважаемого положения в общине.