Фамилия Саиханов отвечает на вопрос «чей?» и образована от личного мужского имени Саихан — так в тюркской среде называли сына, которому прочили власть и достаток. Само имя Саихан — это фонетический вариант более старой формы Саитхан, и в нем соединились два пласта: арабский и тюркский.

Первая основа восходит к арабскому имени Саит. Его значения в разных источниках расходятся: «руководитель», «властелин», «повелитель», «хозяин, господин», а также «счастливый». Вторая часть — тюркский компонент «хан». Слово «хан» изначально обозначало вождя племени, например у кочевников Ирана и Афганистана, а со временем стало княжеским титулом. В Монгольской империи XIII–XIV веков ханом именовали правителя улуса.

Компонент «хан» часто входил в состав мусульманских мужских имен, и родители, нарекая так ребенка, не просто следовали моде, а вкладывали в имя пожелание: пусть сын достигнет положения, сравнимого с ханским, будет богат и уважаем. Это типичная модель для тюркских народов, где составные имена с титулами служили своего рода оберегом и программой на будущее.

Сам суффикс «-ов» в фамилии Саиханов — русский патронимический, он закрепился, когда тюркские имена и прозвища адаптировались в русской официальной среде. Фамилия указывает на прямого предка по мужской линии, носившего имя Саихан. Ударение в фамилии чаще всего падает на последний слог, хотя в устной речи встречаются варианты.

Интересно, что в фамилии сохранился не самый частотный вариант имени: форма Саитхан встречается в документах чаще, а Саихан — результат упрощения, когда сочетание «тх» редуцировалось до простого «х», что характерно для живой разговорной речи. Поэтому фамилию Саиханов можно считать маркером того, что предки семьи говорили на одном из тюркских диалектов, где такое стяжение было естественным.