Фамилия Сагинур — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели образования от крестильных имён, прозвищ или профессий. Корень здесь не славянский, а тюрко-персидский, что сразу указывает на географию её происхождения: скорее всего, Поволжье, Приуралье или Западная Сибирь, где веками живут татары, башкиры, казахи.

Основа фамилии — составное мужское имя Сагинур. Оно состоит из двух частей: «сагин» (от тюркского «сагын» — тоска, сожаление, или «сагыну» — тосковать, скучать) и «нур» (араб. نور — свет, сияние). Дословно имя можно перевести как «свет тоски» или «сияние, которого ждут». В мусульманской традиции такие имена с компонентом «нур» (Нурлан, Нурсултан, Гульнора) давали, желая ребёнку быть озарённым благодатью. Первая же часть «сагин» — редкая и поэтичная, она придаёт имени оттенок долгожданности: возможно, ребёнок родился после долгого ожидания или в разлуке.

Фамилия образована без типичного русского суффикса (-ов, -ев, -ин), что характерно для фамилий, которые долго бытовали в тюркоязычной среде и лишь потом попали в русские документы. В метрических книгах или ревизских сказках её могли записать как Сагинуров, но со временем окончание отпало, и фамилия застыла в форме чистого имени. Это отличает её, скажем, от фамилии Сагинбаев, где есть суффикс принадлежности.

Носителей фамилии Сагинур в России немного, в основном они встречаются в Татарстане, Башкортостане и среди казанских татар. Встречается она и в Казахстане, где имя Сагинур (Сәгінұр) тоже известно, хотя и не часто. Предки человека с такой фамилией, скорее всего, не были дворянами или купцами — это крестьянские или ремесленные роды, получившие фамилию по имени основателя семьи. В дореволюционных списках её почти нет: она вошла в обиход в советское время, когда паспортизация закрепила за людьми фамилии именно в такой, «усечённой» форме.