Фамилия Салабутин — редкий случай, когда основа, скорее всего, не русская, а тюркская, но оформлена она по классической русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Салабутин буквально значит «сын (или потомок) Салабуты». В русских фамилиях -ин обычно крепится к основам на -а/-я, и здесь мы видим именно такой случай.

Корень «Салабут» — это искажённое или диалектное тюркское имя. Скорее всего, в основе лежит арабское имя «Салахуддин» (Салах ад-Дин — «благочестие веры»), которое через тюркское посредничество (например, татарское Сәлахетдин) превратилось в более простое для произношения «Салабут». В русских документах XVI–XVII веков такие имена нередко записывали на слух, без строгой орфографии, поэтому «Салахутдин» мог легко превратиться в «Салабута», а от него — в фамилию Салабутин.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где веками жили рядом русские и тюркские народы. Предок-носитель такого имени мог быть крещёным татарином или башкиром, либо русским, получившим прозвище по соседу-мусульманину. Второй вариант — прозвище Салабута могли дать человеку, который торговал или общался с восточными купцами, но эта версия менее вероятна, так как прямое заимствование имени встречается чаще, чем прозвище по этническому признаку.

Интересная деталь: в фамилии нет типичного для русских фамилий суффикса -ов, который обычно присоединяют к тюркским основам (сравните: Салахов, Салахутдинов). Выбор -ин говорит о том, что основа воспринималась как слово женского рода или как личное имя, оканчивающееся на -а. Это косвенно подтверждает, что в быту человека звали именно Салабута, а не Салабут. Встречаются варианты написания через «о» — Салобутин, что характерно для акающих говоров, где безударное «а» звучит как «о».