Фамилия Самлиев — редкий случай, когда модель образования почти прозрачна, а вот корень ставит в тупик. По суффиксу -ев это классическая русская патронимическая фамилия: её основали от имени или прозвища предка, оканчивающегося на мягкий согласный или -ий. Если бы основа была на твёрдый, мы бы увидели Самлов. Вопрос упирается в то, что скрывается под «Самл-».

Первая и самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) есть корень «сам» со значением «число», «счёт», а также личное имя Самлы (буквально — «сосчитанный», «исчисленный»). В именах тюркских народов нередко встречается пожелание, чтобы ребёнок был «сосчитан» среди живых, то есть рос здоровым. Приставка -ий (-ли) в тюркских языках — аффикс обладания: Самлы — «имеющий число», «счётный». Русский суффикс -ев адаптировал это имя в фамилию: Самлиев — «сын Самлы». Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу и Поволжью, где тюркские имена переходили в русские фамилии через метрики и переписи.

Вторая версия, менее правдоподобная, — от русского прозвища. В говорах можно найти «самлить» — делать что-то в одиночку, самому, без помощников. Человека, который привык всё тянуть на себе, могли прозвать Самля. Но эта гипотеза слабая: глагол редкий, а в XVI–XVII веках прозвища на -ля чаще давали по действию (Сопля, Киселя), и они редко становились основой фамилий с суффиксом -ев.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Самлов, Самлин, Самлуков — показывает, что Самлиев стоит в ряду тех, что произошли от личного имени, а не от профессии или места. Если Самлов мог возникнуть от имени Самло (уменьшительное от Самуил), то Самлиев явно уводит нас в сторону другого источника, не библейского.

Итог: скорее всего, предок носителя фамилии Самлиев был тюркоязычным человеком по имени Самлы (или его так прозвали), и при переходе в русскую среду имя оформилось по стандартной модели «имя + ев». Фамилия осталась редкой, не попала в массовые списки, и сегодня её носители — потомки тех, кто сохранил память о корне в искажённой русским ухом форме.