Фамилия Самофеев, вероятно, образована от имени Самотей, которое является просторечной формой церковного имени Самуил. Оно переводится с еврейского языка как «услышанный Богом» или «имя Божие». Чередование т/ф в корне объясняется различными фонетическими влияниями в языке. Согласно другой версии, фамилия Самофеев образована от прозвища Самофей. Оно восходит к украинскому глаголу «самотити», которое переводится как «быть расположенным, стоять отдаленно, изолировано; жить одиноко, одиноко; быть, оставаться без досмотра, внимания». Вполне вероятно, что человек по прозвищу Самофей жил на окраине селения. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Самотей, со временем получил фамилию Самофеев.