Фамилия Санисалов — редкая, с неочевидной на первый взгляд основой. Её разбор заставляет задуматься о двух возможных корнях, и выбор между ними зависит от того, где именно жили первые носители.

Наиболее вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (например, в казахском, татарском, башкирском) слово «санисал» или близкое по звучанию «санысал» могло означать «счетовод», «казначей» или «человек, ведущий подсчет». Сложносоставное слово: «сан» (число, количество) + «исал» (считать, подсчитывать). Таким образом, Санисалов — это потомок человека, который занимался учетом, возможно, при дворе или в крупном хозяйстве. Суффикс -ов указывает на обрусевшую форму: фамилию адаптировали к русской модели, добавив типичное окончание.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — образование от имени или прозвища Санисал, которое могло быть искажением крестильного имени. Например, от Сан (краткая форма от Александра или Савелия) с добавлением неясного компонента «исал». Однако в православных святцах и в известных словарях личных имен (включая работы Суперанской) такого имени нет, что делает эту версию слабой.

Географически фамилия Санисалов тяготеет к регионам с сильным тюркским влиянием — Поволжье, Урал, юг Сибири. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном бытовании: возможно, фамилия возникла в одной конкретной деревне или семье и не получила широкого распространения.

Социальный контекст: носитель такой фамилии в прошлом, скорее всего, был не крестьянином-землепашцем, а человеком, связанным с письменностью, учетом или управлением — писцом, старостой, приказчиком. В тюркской среде это мог быть человек, знавший грамоту и арифметику, что в те времена было редкостью и давало определенный статус.