Фамилия Саптарова — женская форма фамилии Саптаров, и её ключ к происхождению — в основе, которая звучит как «саптар». В русском языке такого слова нет, но в тюркских языках, особенно в башкирском и татарском, «саптар» — это форма глагола «саптырырга», что означает «заставить бежать», «пустить вскачь» или «погнать». Однако прозвище или имя Саптар могло возникнуть не от действия, а от конкретного занятия: так могли называть человека, который гнал лошадей, работал конюхом или даже был наездником. Есть и более прозаичная версия: в диалектах «саптар» — это «торопыга», «непоседа», человек, который всё делает быстро и суетливо.

Модель образования фамилии типична для тюркоязычных регионов России: к основе Саптар добавляется русский патронимический суффикс -ов, который в XIX–XX веках массово присоединяли к татарским, башкирским, чувашским именам и прозвищам при оформлении документов. Суффикс -а в женской форме указывает на принадлежность к роду или семье Саптаровых. Таким образом, Саптарова — это «дочь или жена Саптара».

Географически фамилия тяготеет к Башкортостану и Татарстану, реже встречается у казахов и узбеков, но там она могла сохраниться без русского суффикса — просто Саптар. В русских переписях и метрических книгах фамилия фиксируется с конца XIX века, в основном среди крестьян и мещан Уфимской и Оренбургской губерний. Сословной элиты среди Саптаровых не было — это фамилия простого люда, чьи предки жили в деревне и занимались скотоводством или земледелием.

Спорных версий немного. Иногда Саптаров связывают с арабским словом «сабтар» (сабр — терпение), но это натяжка: фонетический переход «б» в «п» в тюркских языках возможен, но не зафиксирован в ономастике. Правдоподобнее держаться за тюркский глагол «саптыру» — так фамилия обретает и занятие, и характер предка.