Фамилия Сапуанова — женская форма от Сапуанов, и её написание сразу подсказывает, откуда пошла фамилия. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования от прозвища или отчества, а вот корень — сапуан — выбивается из привычного ряда. В русском языке нет слова «сапуан» в общеупотребительной лексике, но зато оно есть в тюркских языках. «Сапуан» — это искажённое или диалектное произношение слова «сабан» (плуг, соха) или «сапун» (мыло). Тюркское влияние на южнорусские и поволжские говоры было сильным, поэтому прозвище Сапуан могли дать крестьянину, который работал с плугом, либо мыловару — человеку, варившему мыло.

Более вероятной выглядит версия с плугом. В тюркских языках «сабан» (через промежуточные формы «сапан», «сапун») означало и орудие труда, и название праздника первой борозды. Прозвище Сапуан мог получить земледелец, искусный пахарь, или же человек, который вёл хозяйство на нови — распахивал целину. В русских говорах Оренбуржья, Башкирии и Татарстана фиксировались фамилии Сапанов, Сапунов, а форма Сапуанов — редкий вариант, сохранивший тюркское звучание корня.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с диалектным глаголом «саповать» — чавкать, хлюпать, издавать звуки при ходьбе по грязи. В этом случае Сапуаном могли прозвать неопрятного или медлительного человека. Но для такой гипотезы нет надёжных словарных подтверждений, и она уступает первой по убедительности.

Фамилия Сапуанова встречается редко, в основном в Поволжье и на Урале — в зоне контакта русского и тюркского населения. Носители фамилии, скорее всего, потомки крестьян-земледельцев или ремесленников, чьё прозвище закрепилось в документах XVII–XIX веков при переписях. О дворянском происхождении речи нет: суффикс -ов в сочетании с тюркским корнем типичен для крестьянских и мещанских родов.