Фамилия Сайбабталов — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркская основа сочетается с русским фамильным суффиксом, причем не самым распространенным. Обычно фамилии на -ов образуются от имен или прозвищ, заканчивающихся на согласный, но здесь основа явно сложная и не сразу поддается членению.

Скорее всего, в основе лежит арабское или персидское имя Сайбабта, которое можно разложить на две части: «сай» (от арабского «сайид» — господин, потомок пророка) и «бабта» (искаженное «баба» — отец или «бахт» — счастье, удача). В тюркских языках, особенно у башкир и татар, такие составные имена были в ходу: Сайбаб (господин-отец) или Сайбахти (счастливый господин). Суффикс -та- здесь мог быть наращением для благозвучия или диалектным вариантом. Таким образом, Сайбабталов — это «сын Сайбабты», то есть человека, которого звали почтительным именем.

Модель образования нестандартна: в русской традиции фамилии на -ов обычно крепятся к основе на твердый согласный (Иван → Иванов), но здесь к основе на -а (Сайбабта) добавили -лов, что встречается редко — например, в фамилиях вроде Шувалов (от Шувай) или Булгаков (от Булгак). Это указывает на то, что фамилия возникла в среде, где русскую модель адаптировали под иноязычное имя, не переделывая его до конца.

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону, особенно к Башкортостану и Татарстану, где распространены составные имена с «сай». Встречается она крайне редко, что говорит либо о локальном бытовании в одном селе или роде, либо о позднем закреплении — возможно, в XIX веке при переписях, когда писарь записал прозвище или имя по-своему.

Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были мусульманами — башкирами или татарами, и их социальный статус мог быть разным: от рядовых общинников до мулл или зажиточных крестьян. Приставка «сай» в имени намекает на уважение в среде, но не обязательно на знатное происхождение — в народной среде такие имена давали и простым людям, желая им удачи и почтения.