Фамилия Сайбукаева — яркий пример того, как по одному только окончанию можно ошибиться в её происхождении. На первый взгляд она кажется русской, адаптированной под суффикс -ев (как Иванов или Петров). Однако на деле это фамилия, типичная для тюркских народов, в первую очередь для кумыков, ногайцев и чеченцев. В русском языке её «причесали» под привычную модель, добавив окончание -а, но основа осталась иноязычной.

Корень фамилии — мужское имя Сайбука (или Сайбук). Оно составное: первая часть «сай» восходит к арабскому «са’ид» — «счастливый», «удачливый», а вторая — «бука» (или «бук») — тюркское слово, означающее «бык», «сильный», «могучий». В сумме имя можно перевести как «счастливый и сильный» или «удачливый, как бык». Такие двусоставные имена были популярны у народов Кавказа и Поволжья как обереги: считалось, что имя, включающее в себя названия сильных животных, передаст ребёнку их мощь.

Фамилия образована по патронимическому принципу: Сайбукаев — потомок Сайбуки. Суффикс -ев здесь не русский, а скорее графический способ передать тюркское окончание принадлежности (-ев/-ов) на письме. По этой причине фамилия не склоняется по мужскому роду в русском языке так же, как, например, фамилии на -ых, хотя в быту её часто склоняют.

Географически фамилия Сайбукаева распространена в Дагестане, Чечне, Ингушетии, а также среди ногайцев Ставрополья. Встречается и у астраханских татар. Социальный контекст говорит о том, что предки носителей фамилии были, скорее всего, свободными общинниками или узденями (в сословной иерархии горских народов это незнатное, но и не зависимое сословие). Фамилия не княжеская и не духовная, что подтверждается отсутствием арабских религиозных компонентов в основе имени.

Важно отметить, что написание «Сайбукаева» с буквой «а» на конце — это русифицированная женская форма. Мужская форма фамилии — Сайбукаев. В разговорной речи носители фамилии часто произносят её с ударением на второй слог: Сайбу́каев, хотя в официальных документах встречается вариативность.