Фамилия Сайганова образована от имени Сайган. По одной из версий, оно восходит к слову «сайга» – парнокопытное степное животное семейства полорогих. Имя же Сайган могли дать резвому ребенку. Согласно другой гипотезе, в основе этого имени лежит монгольское слово «сайхан» - «благополучный». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Сайгановых можно лишь на основании генеалогических исследований.