Фамилия Сайпулаева образована от имени Сайпула, графического варианта имени Сайпулла. Вероятно, оно состоит из двух основ: «сайп» и «улла». Скорее всего, основа «сайп» восходит к арабскому слову «сайф», что в переводе на русский язык означает «меч». Существует и самостоятельное имя Сайф, имеющее ряд форм: Сайфи, Сейфи, Сейпи. Второй корень – «улла» - с арабского можно перевести как «Аллах». Таким образом, дословно трактовать имя Сайпула можно как «меч Аллаха». Возможно, давая подобное имя своему сыну, родители надеялись, что он вырастет сильным, смелым, хорошим воином. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому точно определить время и место происхождения рода Сайпулаевых можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований.