Фамилия Сефиханова — женская форма мужской фамилии Сефиханов, которая образована по распространённой в тюркских языках модели: личное имя + титул «хан» + русский патронимический суффикс -ов. В основе лежит имя Сефи — вариант арабского имени Сафи (صفی), что означает «чистый», «искренний», «избранный». В исламской традиции это один из эпитетов пророка Мухаммада, а также нередкое личное имя в семьях, почитающих суфизм. Добавление «хан» в таком контексте — не столько указание на реальный ханский титул, сколько почтительная форма, распространённая у народов Кавказа, Поволжья и Средней Азии: имя + «хан» давали мальчикам, желая им благородства и силы.

Словообразовательная цепочка проста: Сефи (имя) + хан (почётный компонент) → Сефихан (составное личное имя) + -ов (русский суффикс принадлежности) → Сефиханов. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской административной среде, вероятно, в XIX — начале XX века, когда представителей тюркоязычных народов империи записывали в метрики и переписи по отчеству с русским окончанием. Женская форма Сефиханова — естественное грамматическое согласование.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где традиционно сильны тюркские и иранские языковые влияния: Дагестан, Азербайджан, Татарстан, Башкортостан, а также среди таджиков и узбеков. У лезгин, аварцев и других народов Дагестана имя Сефи (иногда в форме Сефу) встречается в родовых именах, и фамилия могла возникнуть независимо в нескольких селениях. Встречаются варианты написания: Сафиханов, Сафыханов — через «а» в первом слоге, что связано с разной передачей арабской гласной.

Спорных версий здесь немного. Иногда пытаются вывести первый компонент от тюркского «сефи» в значении «глупый» — но это натяжка: такое толкование не подтверждается ни частотой употребления, ни ареалом фамилии. Арабское происхождение имени Сефи и его почётная форма с «ханом» — версия, подкреплённая и ономастическими справочниками, и живой традицией имянаречения у мусульманских народов.

Сословно носители фамилии Сефихановы — это, как правило, не дворяне, а свободные крестьяне, ремесленники или духовные лица (муллы, кадии). Встречаются и купеческие семьи, особенно в Закавказье, где имя Сефи могло передаваться из поколения в поколение как родовое.