Фамилия Сеилбекова — женская форма фамилии Сеилбеков. Она явно тюркского происхождения, вероятнее всего, казахского. Основа фамилии — составное мужское имя Сеилбек, которое образовано по типичной для тюркских языков модели: «Сеил» + «бек». Вторая часть, «бек» (или «бий»), означает «господин», «князь», «вождь», и часто встречается в именах знати и военачальников.

Первая часть — «Сеил» — менее однозначна. Скорее всего, это вариант имени Сейил (Сейіл) или Сеилхан. В казахской ономастике имя Сейіл связывают с арабским корнем «сайль» — «поток», «разлив», но в переносном смысле это может означать «щедрый», «обильный», как поток воды. Есть и другая версия: «Сеил» может быть диалектной или сокращенной формой от «Сейіт» (Сейид) — титул потомков пророка Мухаммеда у мусульман. В этом случае имя Сеилбек означало бы «господин из рода сейидов». Обе версии правдоподобны, но первая (от «поток/щедрый») встречается в источниках чаще применительно к простонародным именам, тогда как вторая тяготеет к религиозной знати.

Фамилии на -ов/-ев у казахов, как и у русских, закрепились в XIX–XX веках, в основном при советской паспортизации. Раньше тюркские народы обходились без фамилий: человека называли по имени отца (Сеилбеков — буквально «сын Сеилбека»). Таким образом, предок носительницы фамилии, скорее всего, был уважаемым человеком в своем ауле — либо по рождению (от «бек»), либо по характеру (щедрый, как поток). Фамилия не указывает на конкретное ремесло или сословие, но говорит о патриархальной родовой структуре, где имя отца становилось родовым знаком.

Географически фамилия Сеилбекова распространена в Казахстане, особенно в южных и западных областях (Туркестанская, Кызылординская, Мангистауская). В России встречается редко, в основном у казахов, переехавших в приграничные регионы. Отличительная черта фамилии — она почти не имеет однокоренных вариантов за пределами казахского языка, что делает её четким маркером этнического происхождения.