Фамилия Сексеналинов — один из тех редких случаев, когда основа лежит на поверхности, но вызывает вопросы. Корень здесь — «сексенал» или «сексеналий», что напрямую связано с латинским словом sexennalis (шестилетний). В русском языке это слово закрепилось в церковной и учебной среде: сексеналием называли шестилетний курс обучения в духовных семинариях, а также соответствующий класс. Таким образом, Сексеналинов — это семинарская фамилия, образованная от названия учебного заведения или его ступени.

Фамилии на -ов/-ев, произведённые от названий классов, — характерная черта русского духовного сословия. Рядом с Сексеналиновым стоят Грамматин, Философов, Инфимов, Риторин. Священники и их дети нередко получали фамилии при поступлении в семинарию, и часто эти фамилии были искусственными, «говорящими» — они указывали на успехи ученика или на предмет, который он изучал. Сексеналинов мог означать «сын того, кто учится в сексенале» или просто «относящийся к шестилетнему курсу».

Интересно, что в отличие от фамилий на -ский (например, Сексеналинский), которые чаще указывали на место или принадлежность к учебному заведению, вариант на -ов подчёркивает именно личную, родовую связь: «чей?» — Сексеналинов. Это делает фамилию более «семейной», хотя по сути она остаётся книжной, оторванной от крестьянского быта. Носители такой фамилии — почти наверняка потомки семинаристов или церковнослужителей, получивших образование в XVIII–XIX веках.

Географически фамилия редкая и, скорее всего, локальная. Встречается в основном в центральных губерниях России, где были духовные семинарии. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) прямого упоминания Сексеналинова нет, но модель полностью вписывается в описанный им пласт искусственных семинарских фамилий. Спорных версий происхождения немного: попытки связать фамилию с тюркскими корнями или с числительным «шесть» в бытовом смысле несостоятельны — слишком специфична латинская основа.

Сегодня Сексеналинов — фамилия-уникум, почти не встречающаяся за пределами России. Для её носителя это прямой указатель на то, что предки были людьми грамотными, учились в духовной школе и, вероятно, служили в церкви.