Фамилия Селезерцев — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих), который указывает на принадлежность: «чей?» — Селезерцев, то есть сын, потомок или человек из семьи Селезерца. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Селе́зерцев.

Главная загадка — в основе «Селезер». В русской ономастике известна фамилия Селезнёв (от «селезень» — самец утки), и Селезерцев — её редкая диалектная или фонетическая разновидность. В говорах северных и центральных областей России слово «селезерь» или «селезёр» могло обозначать того же селезня, но с иным суффиксом или перегласовкой. Сравните: в некоторых местностях утку-самца называли «селезень», а в других — «селезёр» или «селезирь». Таким образом, прозвище Селезер (или Селезерец) скорее всего дали человеку, чем-то напоминавшему эту птицу: возможно, походкой, голосом, цветом волос или одежды. В русской традиции прозвища от названий птиц — одни из самых распространённых, и «утка» (в лице селезня) здесь не исключение.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с топонимом. На карте России есть несколько мелких населённых пунктов с корнем «Селез-» (например, Селезни, Селезнёво), но формы «Селезер» в географических названиях не зафиксировано. Поэтому версия с прозвищем от птицы остаётся основной.

Суффикс -ец в основе (Селезерец) мог указывать на выходца из какой-то местности или на уменьшительно-ласкательную форму, но в данном случае он, вероятно, просто оформил прозвище в существительное мужского рода, от которого и пошла фамилия. Встречаемость фамилии крайне низкая: она практически не фиксируется в современных базах данных за пределами единичных семей, что говорит о её локальном происхождении, возможно, из одной северной или сибирской деревни, где искажённое «селезень» закрепилось в документах именно как «Селезер».