Фамилия Селиксар — редкий случай, когда географический корень почти не оставляет сомнений в происхождении. В основе лежит название реки Селиксар (Селексар) в Мордовии, правого притока Суры. Эта река протекает по территории современной Пензенской области и Мордовии. Скорее всего, фамилию получил человек, живший на берегах этой реки или выходец оттуда. Формант -ар в названии реки — типичный для финно-угорской топонимики (ср. Инсар, Шукшар), что указывает на эрзянские или мокшанские корни гидронима.

Модель образования фамилии нестандартна. В русской ономастике фамилии от названий рек обычно оформляются суффиксами -ский/-цкий (например, Волжский, Иртышов). Здесь же мы видим чистую основу без патронимического суффикса — Селиксар. Такая модель характерна для украинских и белорусских фамилий, а также для некоторых русских фамилий, возникших в среде однодворцев или казачества, где прозвище по местности могли закрепить без изменений. В данном случае фамилия могла быть записана в церковных книгах как «Селиксар» — буквально «тот, кто с Селиксара».

Суффикс -ар в русских фамилиях встречается редко. Он не является типично славянским и чаще всего указывает на тюркское или финно-угорское влияние. В Поволжье, где протекает река Селиксар, такие фамилии могли возникать на стыке культур. Альтернативная, но менее вероятная версия связывает фамилию с личным именем Селевк (греческого происхождения, от «селевкос» — «блеск»), которое в народной речи могло трансформироваться в Селиксар. Однако против этого говорит отсутствие распространённости имени в русских святцах и наличие реального географического объекта.

Социальный контекст: носители фамилии Селиксар исторически концентрировались в Пензенской губернии и Мордовии. Это были преимущественно государственные крестьяне, реже — однодворцы. В метрических книгах XIX века фамилия встречается в селах по Суре и её притокам. Известных широкой публике носителей с такой фамилией нет, что делает её особенно ценной для локальной генеалогии.