Фамилия Селимагин — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или арабская, но оформлена по русской модели. Ключ к разгадке — суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Селимагин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Селимага.

В основе лежит имя Селим (араб. «здоровый, невредимый», одна из форм от «Салим»). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, к нему могли добавлять уменьшительно-ласкательный или прозвищный суффикс -ага (от тюркского «ага» — старший брат, господин, уважаемый человек). Так из имени Селим и слова «ага» сложилось прозвище Селимага — «господин Селим» или «уважаемый Селим». В русской среде это прозвище «перевели» в фамилию, прибавив стандартный суффикс -ин.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили крещёные татары или народы Поволжья, а также к южнорусским областям, где было сильное влияние тюркской культуры. В дореволюционных переписях и метрических книгах Селимагины встречаются в Казанской, Симбирской и Самарской губерниях. Второй, менее вероятный вариант: прозвище могли дать по названию населённого пункта вроде Селимагино (если такой существовал), но письменных подтверждений этому нет.

Словообразовательная модель здесь необычна: двойная адаптация. Сначала тюркское составное прозвище (Селим + ага) закрепилось как личное имя или прозвище, а затем получило русский фамильный суффикс. В отличие от фамилий на -ов (Селимов), суффикс -ин указывает на более тесную, почти семейную связь с конкретным человеком — Селимагой. Сословно носители фамилии, судя по архивным данным, были в основном государственными крестьянами и мещанами, реже — однодворцами. Дворянских родов Селимагиных не зафиксировано.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Селимов, Селимовский, Селимханов), то Селимагин — самая русифицированная форма, где тюркский компонент «ага» полностью слился с основой, и носитель может даже не догадываться, что его фамилия сложена из двух слов.