Фамилия Семерухина — женская форма фамилии Семерухин, и её разговор по сути сводится к разбору мужского варианта. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Семеруха, которое образовано от числительного «семь». Это сразу ставит фамилию в ряд с Семериковым, Семерниным и Семеруковым, но с характерным суффиксом -ух(а), который в русских говорах придавал слову оттенок простонародности, а иногда и пренебрежительности.

Самая прямая версия: Семерухой называли седьмого ребёнка в семье. В крестьянской среде, где детей было много, порядковый номер становился устойчивым домашним прозвищем, которое потом закреплялось за потомками. В пользу этого говорит и то, что фамилии на -ухин (Белухин, Голодухин, Шестухин) чаще всего встречаются в северных и северо-восточных областях России — в Вологодской, Архангельской, Кировской губерниях. Там же фиксируется и Семерухин, хотя фамилия редкая и нечастотная.

Есть и вторая, менее вероятная версия: прозвище могло закрепиться за человеком, который входил в «семерик» — объединение из семи человек (например, артель из семи работников, или семеро солдат в одном расчёте). Но эта гипотеза слабее: прозвища по порядку рождения встречаются гораздо чаще, чем по численности группы.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Семерухин — сын Семерухи. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён на -а/-я. Фамилия Семерухина, таким образом, означает «дочь или жена Семерухина», хотя в бытовом употреблении за женщиной закрепилась форма на -а без изменения смысла.

В дореволюционных переписях Семерухины встречаются в основном среди государственных крестьян, то есть людей лично свободных, но приписанных к общине. Никакого дворянского или купеческого следа у фамилии нет — это чисто крестьянская ономастика, что типично для прозвищ по числу детей.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Семерухин стоит особняком: Семериков образован от «семерик» (мера веса или объёма), а Семерухин — напрямую от человека. Спорных моментов немного: только сомнительная версия про артель, которую ономасты обычно не рассматривают всерьёз.