Фамилия Семисенко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, самой распространённой на Левобережной Украине, особенно в Полтавской, Черниговской и Сумской областях. Суффикс -енко исторически означал отчество или принадлежность к роду: буквально «маленький», «сын» или «потомок» того, кто назван в корне. В данном случае основа — Семис, что сразу ведёт к вопросу: это полное имя или прозвище?

Корень Семис скорее всего восходит к форме Семён (каноническое церковное имя Симеон, в народной речи — Семён). В украинской традиции распространены усечённые или патронимические формы: Семис — это либо краткое производное от Семён (подобно Семко, Семенко), либо фонетический вариант, где конечное -с возникло под влиянием других уменьшительных суффиксов. Менее вероятна связь с числительным «семь» (семис — «семикратный»), хотя в прозвищной культуре такое тоже возможно, но для фамилий на -енко типичнее личное имя.

Таким образом, Семисенко — потомок человека по имени или прозвищу Семис. Первые носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками, поскольку именно в этих сословиях украинская модель на -енко закрепилась массово в XVI–XVII веках. Дворянские роды с таким суффиксом встречаются реже, но не исключены.

Географически фамилия Семисенко сегодня встречается в России и на Украине, но её очаг — центральные и восточные области Украины. В русских переписях она могла записываться с окончанием -ов (Семисенков) или оставаться без изменений, если носитель переезжал из украинских губерний.

Интересная деталь: в отличие от фамилий типа Семёнов (распространённых по всей России) или Семененко (более частых на Украине), Семисенко — более редкий вариант, сохранивший локальный говор или индивидуальное прозвище основателя рода. Если сравнивать с однокоренными: Семенко (прямое от Семён), Семисенко (через промежуточную форму Семис) — разница в один суффикс, но она указывает на конкретную ветвь семьи.